Protopopova M.V., Takhteev V.V., Shatilina Zh.M., Pavlichenko V.V., Axenov-Gribanov D.V., Bedulina D.S., Timofeyev M.A.  Small HSPs molecular weights as new indication to the hypothesis of segregated status of thermophilic relict Gmelinoides fasciatus among Baikal and Palearctic amphipods. Journal of Stress Physiology & Biochemistry, Vol. 7, No. 2, 2011, pp. 175- 182.

     Axenov-Gribanov, D. V., Gurkov, A. N., Shakhtanova, N. S., Bedulina, D. S., Timofeyev, M. A. and Meglinski, I. (2011), Optical diagnostic test of stress conditions of aquatic organisms. Journal of Biophotonics, Journal of Biophotonics, 4: 4: 619–626 (cover page). 

    
    Shatilina Z.M., H.W.Riss, M.V. Protopopova, M. Trippe, E.I. Meyer, V.V. Pavlichenko, D.S. Bedulina, D.V. Axenov-Gribanov, M.A. Timofeyev. The role of the heat shock proteins (HSP70 and sHSP) for the thermotolerance of freshwater amphipods from contrasting habitats. Journal of thermal biology, 2011, V. 36, I. 2, P. 142 – 149. (First prize awarded in “2011 BRHE Young Scientists article competition” by Civilian and Research Development Foundation -USA)

    Timofeyev M.A., Protopopova M.V. Stress resistance mechanisms in amphipods from Lake Baikal along a gradient of thermal change with emphasis on HSPs and antioxidant enzymes// in  Cipriano R.C., Bruckner A.W., Shchelkunov I.S., editors. 2011. – Bridging America and Russia with shared perspectives on aquatic animal health. 12 – 20 July 2009. Shepherdstown, West Virginia, USA, 2011 – P. 276 – 283.    
    
    Hofmann, S., Timofeyev, M.A., Putschew, A., Menzel, R., Steinberg, C.E.W. (2011) Leaf litter leachates have the potential to increase lifespan, body size, and offspring numbers in a clone of Moina macrocopa. Chemosphere DOI: 10.1016/j.chemosphere.2011.10.041

     Bedulina D.S., Timofeyev M.A. , Zimmer M, Zwirnmann E, Menzel R, C.E.W. Steinberg Different natural organic matter isolates cause similar stress response patterns in the freshwater amphipod, Gammarus pulex. Environmental Science and Pollution Research, 2010, 17, 261–269.     
 
   Bedulina D.S., Zimmer M., Timofeyev M.A. Sub-littoral and supra-littoral amphipods respond differently to acute thermal stress. Comparative biochemistry and physiology, Part B, 155, 2010, P. 413–418. 

   Steinberg, C.E.W., Ouerghemmi, N., Herrmann, S., Bouchnak, R., Timofeyev, M.A., Menzel, R. Stress by poor food quality and exposure to humic substances: Daphnia magna responds with oxidative stress, lifespan extension, but reduced offspring numbers. Hydrobiologia, 2010, 652:223–236.     

    Steinberg, C., Bedulina, D.S., Pavlichenko, V.V., Timofeyev M.A. (2010) Russischer Flohmarkt am Baikal. Aquaristik Fachmagazin 216, 60-66. 
   
    Тимофеев М.А., Кириченко К.А., Шатилина Ж.М., Губанов М.В., Задереев Е.С. ,  Павличенко В.В.,  Аксёнов-Грибанов Д.В.,   Сапожникова Е.А., Протопопова М.В., Бедулина, Д.С., Тимофеев  М.А.  Сравнительное исследование клеточных механизмов термоустойчивости у представителей популяций Gammarus lacustris Sars, населяющих соленое оз. Шира (респ. Хакассия) и пресный водоем Прибайкалья // Доклады академии наук. 2010, Т. 434, №6, С. 1-4.

    Тимофеев М.А. «Экологические и физиологические аспекты адаптации к абиотическим факторам среды эндемичных байкальских и палеарктических амфипод» Автореферат диссертации на соискание степени доктора биологических наук, 2010, Томск, С.44

    Шатилина Ж.М., Рохин А.В., Побежимова Т.П. Отношение байкальских и палеарктических амфипод к кислороду как фактору среды и механизмы адаптации при снижении его уровня. Сибирский экологический журнал, 2010, 5, с. 717-724. 

   Шатилина Ж.М., Побежимова Т.П., Грабельных О.И., Бедулина Д.С., Протопопова М.В., Павличенко В.В., Тимофеев М.А. Белки теплового шока в механизмах стресс-адаптации у байкальских амфипод и палеарктического Gammarus lacustris Sars: I. Семейство БТШ70. Сибирский экологический журнал, 2010, № 1, с. 57–67.

    Шатилина Ж.М., Бедулина Д.С., Протопопова М.В., Павличенко В.В., Побежимова Т.П., Грабельных О.И., Тимофеев М.А. Белки теплового шока в механизмах стресс-адаптации у байкальских амфипод и палеарктического Gammarus lacustris Sars: II. Семейство низкомолекулярные (малые) БТШ. Сибирский экологический журнал, 2010, № 4, 623-632.

    Тимофеев М. А., Ж. М. Шатилина, В. В. Павличенко, Д. С. Бедулина, М. В. Протопопова, Д. В. Аксенов-Грибанов, Е. А. Сапожникова. Оценка активности механизма множественной резистентности пресноводных амфипод к ксенобиотикам по интенсивности выведения родамина C. Известия Иркутского государственного университета, Серия «Биология. Экология», 2010. Т. 3, № 2. С. 14–19

  Тимофеев М.А., Ж.М. Шатилина. Определение рН-преферендума и чувствительности к уровню растворенного кислорода у байкальских эндемичных и палеарктических амфипод. Амурский зоологический журнал II(1), 2010. С. 3-8.
   

    Steinberg C E W, Timofeyev M A and Menzel R. (2009) Dissolved Humic Substances: Interactions with Organisms. In: Gene E. Likens, (Editor) Encyclopedia of Inland Waters. volume 2, pp. 747-753 Oxford: Elsevier. 
 
    Timofeyev М., Z.M. Shatilina, M.V. Protopopova, D.S. Bedulina, V.V. Pavlichenko, A.V. Kolesnichenko, C.E.W. Steinberg Thermal stress defense in freshwater amphipods from contrasting habitats with emphasis on small heat shock proteins (sHSPs). Journal of Thermal Biology, 34(2009)281–285. 

     Timofeyev M., Protopopova M., Pavlichenko V, Steinberg C. Can acclimation of amphipods change their antioxidative response? Aquatic Ecology, 2009, 43:1041–1045.

     Бедулина Д.С. Влияние температурного фактора на клеточные и биохимические механизмы у байкальских и палеарктических амфипод. Автореферат диссертации на соискание степени кандидата биологических наук. Иркутск, 2009, С.23

    Павличенко В.В., Шатилина Ж.М., Бедулина Д.С., Протопопова М.В., Сапожникова Е.А., Аксёнов-Грибанов Д.В., Бадуев Б.К., Тимофеев М.А. Накопление лактата и белков теплового шока (БТШ) при остром температурном стрессе у байкальских термочувствительных Eulimnogammarus vittatus и Eulimnogammarus marituji (Crustacea, Amphipoda)// Амурский зоологический журнал. 2009.  I(3).  С. 190-196.

    Тимофеев М.А., Лозовой Д.В., Потапов Д.С., Шатилина Ж.М., Сапожникова Е.А., Аксенов-Грибанов Д.В., Павличенко В.В. Вестерн-иммуноблоттинг белков теплового шока у пресноводных гастропод и амфипод, экспонированных в растворах нефти // Известия ИГУ, Серия «Биология. Экология». – 2009. – № 2. – С. 97-107.

    Тимофеев М.А. Активация  антиоксидантной  системы  у байкальского литорального  вида  Eulimnogammarus  verrucosus// Известия Самарского Научного Центра РАН  2009. Т. 11. 1. 177-180.
 

     Steinberg CEW, Meinelt T, Timofeyev MA, Bittner M, Menzel R (2008): Dissolved Humic Substances. Part 2: Interactions with Organisms. Environmental Science and Pollution Research,  15 (2) 128–135.   

     Timofeyev M., Shatilina Z. M , Bedulina D.S., Protopopova M.V., Pavlichenko V., Grabelnich O.I., Kolesnichenko A.V. Evaluation of biochemical responses in Palearctic and Lake Baikal endemic amphipod species exposed to CdCl₂. Ecotoxicol. Environm. Safety, Volume 70, Issue 1, May 2008, Pages 99-105.   

     Chepinoga V.V., Gnutikov A.A., Enushchenko I.V., Chepinoga A.V. IAPT/IOPB chromosome data 6 // Taxon. – 2008. – 57 (4). ~P. 1-2.

    Тимофеев М.А., Шатилина Ж.М., Бедулина Д.С., Протопопова М.В., Павличенко В.В., Колесниченко А.В. Сравнительное исследование клеточных механизмов терморезистентности у байкальского и палеарктического видов эврибионтных амфипод// Сибирский экологический журнал, 2008, № 1, т. 15, с. 23–29. 
     
      Чепинога А.В., Чепинога А.А., Гнутиков А.А., Тимофеев М.А. Обзор кариологической изученности флоры байкальского региона //Известия Самарского Научного Центра РАН //  2008. Т. 10, 5/1. С. 68-73.

     Тимофеев М.А.  Особенности механизмов активации АОС у пресноводных амфипод: II. Байкальский литоральный Eulimnogammarus cyaneus (Dyb.) (Amphipoda, Crustacea) //Сибирский экологический журнал, 2008, т.5 стр. 681-687.
 
     Тимофеев М.А., Ж.М. Шатилина, Д.С. Бедулина, М.В. Протопопова, А.В. Колесниченко. Особенности применения белков теплового шока (БТШ) в качестве стресс-маркеров у байкальских эндемичных амфипод // Прикладная биохимия и микробиология, 2008, т.3. стр. 310-313.

     КолесниченкоА.В., М.А.Тимофеев, М.В.Протопопова. "Токсичность наноматериалов - 15 лет исследований"// Российские нанотехнологии, том 3, № 3-4, 2008, стр. 54 - 61.   Чепинога В.В., Гнутиков А.А., Енущенко И.В. Числа хромосом некоторых видов сосудистых растений флоры Байкальской Сибири // Бот. журн. – 2008. – Т. 93, № 8. – 128-137.

     Чепинога В.В., Росбах С.А. Активность различных видов водной флоры Иркутско-Черемховской равнины // География и природные ресурсы. – 2008. № 1. – С. 97-104.   

    Timofeyev M. , Shatilina Z.  Different preference reactions of three Lake Baikal endemic amphipods to temperature and oxygen are correlated with symbiotic life. // Crustaceana; 2007; 80(2):129-138. 

    Timofeyev M.,  Shatilina Z.M., Bedulina D.S., Menzel, R., Steinberg C.E.W.  Natural organic matter (NOM) has the potential to modify the multixenobiotic resistance (MXR) activity in freshwater amphipods Eulimnogammarus cyaneus (Dyb) and Eulimnogammarus verrucosus (Gerst.)// Comparative biochemistry and physiology, Part B 146 (2007) 496–503.  

    Флора высших растений озера Байкал / М. Г. Азовский, В. В. Чепинога; [отв. ред. Л. В. Бардунов]. – Иркутск : Изд-во Иркут. гос. ун-та, 2007. – 157 с. ISBN 978–5–9624–0211–6. 

    Материалы к флоре Байкальской Сибири: сб. науч. ст. / [отв. ред. В. В. Чепинога]. – Иркутск : Изд-во Иркут. ун-та, 2007. – Вып. 1. – 173 с.
   Кириченко К.А. «Отношение байкальских и палеарктических амфипод к кислороду как фактору среды и механизмы адаптации при снижении его уровня», Автореферат диссертации на соискание степени кандидата биологических наук, 2007, Иркутск, С.20

    Тимофеев М.А.  Изучение  активности некоторых антиоксидантных ферментов у байкальских амфипод,  локализация и размерно-возрастная зависимость //Сибирский экологический журнал, 2007, С. 521 – 526.  

   2006

     Timofeyev M.A., Steinberg C Comparative study of the antioxidant response to natural organic matter (NOM) exposure in three Baikalean amphipod species from contrasting habitats //  Comparative biochemistry and physiology B: Biochemistry and Molecular Biology, 2006 Part B 145 (2006) 197–203.  

     Timofeyev M., Shatilina Z., Kolesnichenko A., Kolesnichenko V., Bedulina D., Steinberg C.  Natural organic matter (NOM) promotes oxidative stress in freshwater amphipods Gammarus lacustris Sars and G. tigrinus (Sexton) // Science of The Total Environment, V.366 (2-3), 2006, P. 673-681.   

     Timofeyev M. Antioxidant enzyme activity in endemic Baikalean versus Palaearctic amphipods: Tagma- and size-related changes // Comparative biochemistry and physiology B: Biochemistry and Molecular Biology, 2006, Vol. 143/3 pp 302-308.

     Timofeyev M., Z. Shatilina, A. Kolesnichenko , V. Kolesnichenko,  S. Pflugmacher, C. Steinberg. Specific antioxidants reaction to oxidative stress promoted by natural organic matter (NOM) in two endemic amphipod species from Lake Baikal // Environmental Toxicology, volume 21, issue 2, 2006, P.104-110.  

     Steinberg C., S. Kamara, V. Prokhotskaya, L. Manusadžianasp, T. Karasyova, M.  Timofeyev, Z. Jie, A. Paul, T. Meinel, V. Farjallap, A. Matsuo, K. Burnison, R. Menzel. Dissolved humic substances – ecological driving forces from the individual to the ecosystem level? (Review) // Freshwater Biology (2006) 51, P.1189–1210.  

     Тимофеев М.А., Кириченко К.А., Бедулина Д.С. Сравнительная оценка особенностей анаэробного метаболизма у байкальских амфипод Eulimnogammarus verrucosus (Gerstf.), E. cyaneus (Dyb.) и палеарктического Gammarus lacustris S ars. //Сибирский экологический журнал 2006 № 6, т. 13, с. 733-739. 

     Тимофеев М.А., Ж.М. Шатилина, А.В. Колесниченко, Бедулина Д.С. Полиморфизм белковых спектров эндемичных амфипод озера Байкал  и  палеарктических видов, влияние температурного стресса // Сибирский экологический журнал, №5, 2006 с. 571-579.

     Тимофеев М.А., Особенности механизмов активации АОС у пресноводных амфипод: I. Палеарктический  Gammarus lacustris Sars (Amphipoda, Crustacea) //Сибирский экологический журнал, №5, 2006, с. 623-628.
 
     Тимофеев М.А., Шатилина Ж.М., Бедулина Д.С., Протопопова М.В., Грабельных О.И., Побежимова Т.П., Колесниченко А.В. Стрессовые белки в механизмах стресс-адаптации байкальских амфипод, сопоставление с палеарктическими видами // Журнал стресс-физиологии и биохимии, Т. 2,  № 1, 2006, С.41-49.

     Тимофеев М.А., Кириченко К.А., Рохин А.В., Бедулина Д.С., Чернышова К.П., Побежимова Т.П.  Индукция анаэробных процессов у байкальских эндемиков Eulimnogammarus vittatus (Dyb.) и E.verrucosus (Dyb.) (Amphipoda, Crustacea) // Журнал стресс-физиологии и биохимии, Т. 2, № 1, 2006, С.56-61.  
 
     Тимофеев М.А., Шатилина Ж.М., Колесниченко А.В. Токсичность солей кадмия для байкальских эндемичных амфипод, некоторые биохимические последствия //Сибирский экологический журнал, №2, 2006, C .243-248.

          Тимофеев М.А.  , Кириченко К.А., Бедулина Д.С., Рохин А.В, Чернышова К. П., Побежимов Т.П. Активация альтернативных путей энергопродукции у байкальского эндемичного вида E. vittatus (Amphipoda, Crustacea)/ Гидробиология водоемов юга Восточной Сибири (Би оразнообразие Байкальского региона: Труды Биолого-почвенного факультета ИГУ, Выпуск 6) –Иркутск: Иркутск. Ун-т, 2006., 94-101.

     Шатилина Ж.М., Бедулина Д.С., Тимофеев М.А.  Оценка антропогенного загрязнения по активности механизма множественной резистентности к ксенобиотикам на примере пресноводных амфипод. / Гидробиология водоемов юга Восточной Сибири (Биоразнообразие Байкальского региона: Труды Биолого-почвенного факультета ИГУ, Выпуск 6) –Иркутск: Иркутск. Ун-т, 2006., 101-111.

    

      Wiegand C., Meems N., Timofeyev M.A., Steinberg C., Pflugmacher S.  More evidence for humic substances acting as biogeochemicals on organisms // in Humic Substances: Nature's  Most Versatile Materials. Eds. E. A. Ghabbour and G. Davies, Francis & Taylor New York. 2004, P.340-372.